根據黨的十七大和十七屆二中全會精神，這次國務院機構改革的主要任務是，圍繞轉變政府職能和理順部門職責關系，探索實行職能有機統一的大部門體制，合理配置宏觀調控部門職能，加強能源環境管理機構，整合完善工業和信息化、交通運輸行業管理體制，以改善民生為重點加強與整合社會管理和公共服務部門。
　　（一）合理配置宏觀調控部門職能。國家發展和改革委員會要進一步轉變職能，減少微觀管理事務和具體審批事項，集中精力抓好宏觀調控。財政部要改革完善預算和稅政管理，健全中央和地方財力與事權相匹配的體制，完善公共財政體系。中國人民銀行要進一步健全貨幣政策體系，加強與金融監管部門的統籌協調，維護國家金融安全。國家發展和改革委員會、財政部、中國人民銀行等部門要建立健全協調機制，形成更加完善的宏觀調控體系。
　　（二）加強能源管理機構。設立高層次議事協調機構國家能源委員會。組建國家能源局，由國家發展和改革委員會管理。將國家發展和改革委員會的能源行業管理有關職責及機構，與國家能源領導小組辦公室的職責、國防科學技術工業委員會的核電管理職責進行整合，劃入該局。國家能源委員會辦公室的工作由國家能源局承擔。不再保留國家能源領導小組及其辦事機構。
　　（三）組建工業和信息化部。將國家發展和改革委員會的工業行業管理有關職責，國防科學技術工業委員會核電管理以外的職責，信息產業部和國務院信息化工作辦公室的職責，整合劃入工業和信息化部。組建國家國防科技工業局，由工業和信息化部管理。國家煙草專賣局改由工業和信息化部管理。不再保留國防科學技術工業委員會、信息產業部、國務院信息化工作辦公室。
　　（四）組建交通運輸部。將交通部、中國民用航空總局的職責，建設部的指導城市客運職責，整合劃入交通運輸部。組建國家民用航空局，由交通運輸部管理。國家郵政局改由交通運輸部管理。保留鐵道部，繼續推進改革。不再保留交通部、中國民用航空總局。
　　（五）組建人力資源和社會保障部。將人事部、勞動和社會保障部的職責整合劃入人力資源和社會保障部。組建國家公務員局，由人力資源和社會保障部管理。不再保留人事部、勞動和社會保障部。
　　（六）組建環境保護部。不再保留國家環境保護總局。
　　（七）組建住房和城鄉建設部。不再保留建設部。
　　（八）國家食品藥品監督管理局改由衛生部管理。明確衛生部承擔食品安全綜合協調、組織查處食品安全重大事故的責任。
　　改革后，除國務院辦公廳外，國務院組成部門如下：
　　１．中華人民共和國外交部
   ２．中華人民共和國國防部
   ３．中華人民共和國國家發展和改革委員會
　　４．中華人民共和國教育部
   ５．中華人民共和國科學技術部
   ６．中華人民共和國工業和信息化部
   ７．中華人民共和國國家民族事務委員會
　　８．中華人民共和國公安部
   ９．中華人民共和國國家安全部
   １０．中華人民共和國監察部
   １１．中華人民共和國民政部
   １２．中華人民共和國司法部
   １３．中華人民共和國財政部
   １４．中華人民共和國人力資源和社會保障部
　　１５．中華人民共和國國土資源部
   １６．中華人民共和國環境保護部
   １７．中華人民共和國住房和城鄉建設部
   １８．中華人民共和國交通運輸部
　　１９．中華人民共和國鐵道部
　　２０．中華人民共和國水利部
　　２１．中華人民共和國農業部
　　２２．中華人民共和國商務部
　　２３．中華人民共和國文化部
　　２４．中華人民共和國衛生部
　　２５．中華人民共和國國家人口和計劃生育委員會
　　２６．中國人民銀行
   ２７．中華人民共和國審計署根據《國務院組織法》規定，國務院組成部門的調整和設置，由全國人民代表大會審議批準。國務院其他機構的調整和設置，將由新組成的國務院審查批準。