12月25日下午，中國科協(xié)書記處書記宋南平主持召開會議，就落實中國科協(xié)與科技部《會商紀要》的工作情況，聽取有關(guān)部門、事業(yè)單位的匯報，研究下一步將要溝通與落實的相關(guān)工作。機關(guān)有關(guān)部門、事業(yè)單位負責(zé)人和聯(lián)系人參加了會議。
2006年1月27日，中國科協(xié)副主席、書記處第一書記鄧楠率隊與科技部部長徐冠華等領(lǐng)導(dǎo)同志就有關(guān)工作進行了溝通。中國科協(xié)與科技部聯(lián)合下發(fā)了《會商紀要》文件，雙方議定了六項主要內(nèi)容：一是科技部繼續(xù)發(fā)揮科普聯(lián)系會議牽頭部門的作用，推動科普事業(yè)發(fā)展；二是科技部與中國科協(xié)聯(lián)合發(fā)文，加強協(xié)調(diào)，推動基層科技工作和科普事業(yè)的發(fā)展；三是聯(lián)合開展對科技工作者基本狀況調(diào)查，更好地為宣傳科技工作和科技工作者服務(wù)；四是在國家有關(guān)科技計劃中，加大力度支持與科普相關(guān)的數(shù)字科技館、科普展品研發(fā)、軟課題研究、科技期刊等工作；五是實行政策引導(dǎo)，積極探索具有條件的全國學(xué)會在本領(lǐng)域開展與科技相關(guān)的平價、咨詢和認證等工作；六是支持中國科協(xié)參與科技部等三部委組織開展的“技術(shù)創(chuàng)新引導(dǎo)工程”的相關(guān)工作。
中國科協(xié)對落實《會商紀要》中的各項工作高度重視，為此科協(xié)共召開了四次會議，具體研究落實工作。各部門、各單位主動加強與科技部的聯(lián)系和溝通，落實《會商紀要》工作取得了一定進展。 
11月，中國科協(xié)與科技部聯(lián)合下發(fā)了《關(guān)于加強縣(市)科技工作和科普事業(yè)發(fā)展的指導(dǎo)意見》；由中國科協(xié)牽頭組織，教育部、中國科學(xué)院參加建設(shè)的“國家科技基礎(chǔ)條件平臺建設(shè)項目”——中國數(shù)字科技館項目進展順利，12月已正式面向公眾開通試運行；中國科協(xié)與科技部合作開展中國科技人力資源研究、科技工作者狀況調(diào)查和科技工作者的社會公眾形象調(diào)查等課題研究，發(fā)揮了積極作用；中國科協(xié)參與“技術(shù)創(chuàng)新引導(dǎo)工程”的相關(guān)工作取得積極進展，如“講創(chuàng)新、比貢獻”競賽活動在各地引起強烈反響。
宋南平在會上指出，抓好《會商紀要》的落實工作，是中國科協(xié)的一件大事，對中國科協(xié)事業(yè)發(fā)展具有深遠意義。各部門、各單位要認真貫徹落實黨組、書記處的指示精神，搞好2006年的工作總結(jié)，查找存在的問題和不足，研究2007年工作思路，爭取取得更大的成績。計劃財務(wù)部作為這項工作的聯(lián)絡(luò)和協(xié)調(diào)部門，要積極主動加強與科技部有關(guān)部門的聯(lián)系，做好組織、協(xié)調(diào)和服務(wù)工作。